El origen de los Quilmes se hunde en la bruma de la historia. Hay varias teorías al respecto y la más aceptable, dada la similitud racial con pueblos altoperuanos y peruanos, es que provienen del norte. Habrían realizado una larga peregrinación en busca de una “tierra de promisión” de la cual hacer su patria y la hallaron al noroeste de la provincia de Tucumán, en una de las áreas arqueológicas más ricas de la Argentina: el valle de Santa María o Yocavil.